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Shanghai Yise Medical Technology Co.,Ltd.



《支原体基因组DNA提取试剂盒》(离心柱法)说明书(版本20201218)




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货号

​MG015


包装规格

50次/盒


储存条件

该产品常温运输,室温保存(收货后,其中的Proteinase K放-20˚C保存)。该条件下,至少3年内有效。Proteinase K溶液可以在室温保存6-12个月,长期保存需要放-20˚C。



产品简介

《支原体基因组DNA提取试剂盒》(离心柱法)(Mycoplasma Genomic DNA Extraction Kit with Columns)的操作方法和试剂配方已经针对支原体的特点做了优化,专门用于从体外培养的细胞、细胞上清、血清、血浆、全血、生物制品等样品中提取支原体基因组DNA。提取的支原体基因组DNA可用于《一步法恒温支原体检测试剂盒》、《PCR法支原体检测试剂盒》和《探针法支原体检测试剂盒》。

支原体基因组DNA的提取有两个作用:(1)可以去除所有可能抑制PCR扩增的成分或者干扰《一步法恒温支原体检测试剂盒》显色的成分,保证后续PCR扩增的正常进行或者《一步法恒温支原体检测试剂盒》的显色不被干扰;(2)具有浓缩支原体DNA的作用,可以提高相对检测灵敏度10-100倍。



产品组份(50次)


蛋白酶K溶液:Proteinase K(20 mg/mL)


溶液GR:Buffer GR, 15 mL


溶液GL:Buffer GL, 15 mL


清洗液GW1:Buffer GW1(Concentrate), 13 mL


清洗液GW2:Buffer GW2(Concentrate), 15 mL


洗脱液EB:Elution Buffer EB, 15 mL


吸附柱:Spin Columns DM, 50个


收集管:Collection Tube, 50个


需自备的试剂和耗材:(1)无水乙醇;(2)1.5 mL离心管




操作步骤


1. 实验前准备及重要注意事项

1) Buffer GW1和Buffer GW2的配制:第一次使用前,应按照试剂瓶标签的说明先在Buffer GW1和Buffer GW2中加入无水乙醇,并在试剂瓶标签中做好标记。

2) 使用前请检查Buffer GL是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀,请将Buffer GL于56˚C水浴孵育重新溶解。

2. 样品处理:本试剂盒优选体外培养的细胞上清(贴壁细胞直接取细胞培养上清、悬浮培养细胞取低速离心后的离心上清)、血清、血浆、溶液型生物制品作为提取支原体基因组DNA的样品。如果是粉末型样品,需用水溶解后,再进行后续操作。

注1:体外培养的贴壁细胞培养上清或悬浮细胞,经1200 rpm(约150 g)低速离心5分钟后(切记:此步骤离心力不能太大,否则支原体会被离心去除了!),取离心后上清进行检测。

注2:如果初始样品是加了抗凝剂的全血,经1200 rpm(约150 g)低速离心10分钟后(切记:此步骤离心力不能太大,否则支原体会被离心去除了!),取上层血浆进行检测。也可以不经过低速离心,直接取200 μL全血进行后续操作。

注3:如果初始样品是未加抗凝剂的全血,待血液凝固后,取血清进行检测。

3. 取上述细胞上清、血清、血浆、生物制品等样品200 μL,用移液枪吹吸均匀后,进行后续操作。

注1:当样品量小于200 μL时,加入Buffer GR补足至200 μl,再进行下一步实验。

注2:如果预期待测样品支原体含量较少(比如长期低温保存的血清、血浆、胰酶、生物制品等),可以取上述样品1 mL,加入1.5 mL离心管内,13000 rpm(约16000 g)高速离心 5 分钟。吸走离心后的上清800 μL,剩余200 μL用移液枪吹吸均匀后,进行后续操作。此步骤起浓缩支原体的作用,从而提高支原体检测的相对灵敏度。如果需要,上述样品的体积可以进一步放大,经过多次高速离心后,剩余200 μL用于后续操作(比如,如果初始体积是5 mL,经5次高速离心,取剩余的200 μL进行后续操作,最终用50 μL 洗脱液进行洗脱,则支原体DNA大约浓缩了100倍,支原体检测的相对灵敏度也大约提高了100倍。) 

4. 向以上溶液中加入20 μL Proteinase K(20 mg/mL)溶液,混匀。

5. 加入200 μL Buffer GL(如果室温较低,使用前请检查Buffer GL是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀,请将Buffer GL于56˚C水浴孵育重新溶解),用吸头充分吹吸均匀或用Vortex充分震荡。

注意:不要将Proteinase K和Buffer GL进行预混,否则Proteinase K可能失活。

6. 将离心管放置56˚C水浴,孵育15分钟。

注意:此步骤不能省略!

7. 加入2 μL支原体qPCR内参质粒mycoIC2(注意:内参质粒mycoIC2请吹吸均匀后,再加入。内参质粒mycoIC2只在本公司《探针法支原体检测试剂盒》内含有,如果使用其他支原体检测方法,本步骤可以跳过!)。

注1:此步骤只有使用本公司《探针法支原体检测试剂盒》时,需要加入支原体qPCR内参质粒mycoIC2。

注2:加入的内参质粒mycoIC2用于监控支原体DNA的提取和后续支原体qPCR的扩增是否有效。

8. 加入200 μL无水乙醇,上下颠倒混匀数次。

注意:此处不能高速离心!如果需要(一般不需要离心),只能1000 rpm(约100 g)低速短暂离心(20 Sec),使管壁和壁盖上的液体集中到管底。

9. 用1 mL吸头将所得溶液全部(含管壁和盖子上溶液)加入到已装入收集管的吸附柱(Spin Columns DM)中。12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

10. 向吸附柱中加入500 μL Buffer GW1(使用前检查是否加入无水乙醇!),盖上盖子,将吸附柱快速颠倒一次(目的:清洗管壁和盖子中的杂质),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

11. 向吸附柱中加入500 μL Buffer GW2(使用前检查是否加入无水乙醇!),盖上盖子,将吸附柱快速颠倒一次(目的:清洗管壁和盖子中的杂质),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

12. 再次清洗:向吸附柱中加入600 μL Buffer GW2(使用前检查是否加入无水乙醇!),盖上盖子,将吸附柱快速颠倒一次(目的:清洗管壁和盖子中的杂质),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

13. 继续12,000 rpm离心2分钟。离心后,在亮光下,仔细检查吸附柱内部吸附膜上方的塑料垫圈四周是否有液体残留。如果发现吸附柱内部塑料垫圈四周有液体残留,可以将吸附柱放回收集管内,将有液体残留的一侧放在离心力内侧,继续12,000 rpm离心1分钟。

14. 离心后,经仔细检查,如果确认吸附柱内部塑料垫圈四周没有液体残留,则可以丢弃收集管,将吸附柱置于一个新的1.5 mL离心管(自备)中,打开吸附柱盖子,置于50-65℃的烘箱内放置至少15分钟,以让吸附膜中的乙醇彻底挥发干净(请务必放在50-65℃的烘箱内放置!如果室温放置,不仅时间需要延长,还不排除有些样品由于乙醇挥发不干净,影响后续PCR扩增效率,甚至彻底失败)。

注意:打开吸附柱盖子,将吸附柱放在50-65℃的烘箱内至少15分钟,此步骤非常关键!如果没有烘箱,强烈建议购买一个。这一步的目的是将吸附膜中残余的乙醇彻底去除,乙醇的残留会严重影响后续的酶促反应(如:酶切、PCR扩增等),甚至可能导致后续的PCR彻底失败。

15. 向吸附柱的中间部位悬空加入50 μL Elution Buffer EB,室温放置3分钟,12,000 rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存。

注1:本公司的Elution Buffer EB是经过优化的洗脱液,该洗脱液与本公司的所有基于核酸扩增技术的支原体检测试剂盒完全兼容(包括:一步法恒温支原体检测试剂盒,PCR法支原体检测试剂盒和探针法支原体检测试剂盒)。如果是其他公司DNA提取试剂盒的洗脱液,当反应体系中样品DNA量加大后(比如反应体系中DNA加入量由2 μL变为20 μL时)有可能会影响到核酸的扩增效率。

注2:如果样品的初始体积分别是200 μL、1 mL或5 mL,经最后50 μL洗脱,则支原体DNA分别大约浓缩了4倍、20倍或100倍,支原体检测的相对灵敏度也大约提高了4倍、20倍或100倍。